оно начало молотить и в это время пропала связь? Вроде бы даже запуск в фоне (&) не поможет? В общем, можно ли запустить удалённо, отсоединиться (и не бояться обрывов), а потом подсоединиться и проконтролировать процесс?
Возможно все что угодно, вдруг зависимости кривые будут по пакетам или make.conf не верно настроен и на середине обновления ошибка.
Лучше иметь способ по ipkvm подключиться и исправить.
На середине обновления ошибок ни разу не было, исключая ошибки компиляции конкретного пакета, и после вылета portage продолжает работу, компилит следующие. То есть оно само обычно доходит до конца. Подключиться можно позже по ssh и исправить и продолжить, а ipkvm в gentoo вроде нет.
Как вариант написать демон init запуска с логированием, а его уже запускать через ssh. Нужную информацию просматривать в логах.
В демон можно добавить нужные опции, прекратить, поставить на паузу возобновить: