1. Надежность и стабильность системы. У меня комп под Линуксом месяцами круглосуточно работает и ни разу не было проблем, вроде знаменитого "голубого экрана М$".
2. Возможность самому разобраться в причине КАЖДОЙ проблемы и решить ее.
3. Отсутствие вирусов и троянов.
4. Грамотная многозадачность
5. Можно апгрейдить и устанавливать софт без перезагрузки системы.
6. Вертикальная совместимость версий софта и форматов данных (Кому приходилось переносить чертежи из 10-го в 14-й ACAD, поймет

)
7. Бесплатность
8. Возможность настройки десктопа под себя, а также большой выбор оконных менеджеров (сам юзаю fvwm, когда хочу показать гибкость какому-нибудь "под-оконнику" - запускаю gnome).
9. Не страшно давать доступ криворукому студенту.
10. Возможность автоматизировать рутину и перебор больших объемов данных.
11. Категорически не нравится политика Мелкософта.
12. Если что-то настроил в Линуксе - это будет работать, пока работает железо в компьютере.
Послужной список: Slackware-3.x, RedHat-4.x,5.x,6.x,7.x, FedoraCore-3, Debian Etch/Lenny
Осваиваю: RHEL-5.4