Хочется чтоб согласно идеологии unix-way, некая софтина без костылей хватала каждую новую точку и аккуратно добавляла на график (без перезапуска, как это делает gnuplot).
(echo 'plot "output"'; ./script.sh | tee -a output | while read line; do echo replot; done) | gnuplot
Итак, тут script.sh — скрипт, неторопливо плюющий координаты точки в формате "xi yi"; outpot — файл с получающимися координатами, изначально имеет строку "0 0" (костыль).
Думаю тему можно закрывать, хотя буду рад, если народ поделится альтернативами.