Что прописывать в строке USE="" в /mnt/gentoo/etc/make.conf при установке с минимал сиди? В одних мануалах написано примерно следующее: USE="gtk gnome X alsa cdr dvd" в настольной книге генту вообще написано
USE="x86 oss apm arts avi berkdb bitmap-fonts crypt cups encode fortran f77
foomaticdb gdbm gif gpm gtk imlib jpeg kde gnome libg++ libwww mad
mikmod motif mpeg ncurses nls oggvorbis opengl pam pdflib png python qt
quicktime readline sdl spell ssl svga tcpd truetype X xml2 xmms xv zlib"
Если читать не между строк, то можно увидеть, что там написано В USE флагах надо писать что тебе нужно, так как все компилируется с поддержкой тех или иных опций. Читай хэндбук